El CICR mantiene una fuerte presencia operacional en África. Sus actividades se concentran en los ámbitos de protección y asistencia en favor de las personas afectadas por los conflictos armados o por otras formas de violencia. Además, realiza tareas de promoción del derecho internacional humanitario en todo el continente, a fin de que se reconozca y aplique en mayor medida esta rama del derecho.
 
La República Democrática del Congo (RDC), Somalia y Sudán figuran entre las operaciones más grandes del CICR en todo el mundo. A pesar de las iniciativas internacionales por la paz, la situación sigue siendo frágil en Kivu Norte y Sur, en las provincias del este de la RDC, en la región de Darfur, en el oeste de Sudán y en el centro y el sur de Somalia, donde numerosas personas, principalmente civiles, sufren las consecuencias, como la muerte, heridas, desplazamientos y dificultades económicas.
 
En la República Centroafricana, el CICR está aumentando sus esfuerzos por responder a las necesidades de las personas afectadas por el conflicto en el norte del país. En el este de Chad, región propensa a la inseguridad crónica y la violencia localizada, el CICR presta asistencia a las personas desplazadas, los heridos, los indigentes y los detenidos. En el norte de Mali, Níger y Nigeria, el CICR trabaja conjuntamente con las Sociedades Nacionales respectivas a fin de ayudar a los civiles que se vieron forzados a huir de los enfrentamientos esporádicos entre las fuerzas gubernamentales y diversos grupos armados.
 
En Etiopía, las actividades han disminuido significativamente, dado que en 2007 el Gobierno decidió expulsar al CICR del Estado Regional Somalí. En situaciones como las de Côte d'Ivoire, Eritrea, Liberia y Uganda, donde las personas desplazadas están comenzando a volver a sus hogares, el CICR se propone reducir la ayuda de emergencia y colaborar con las comunidades que deben reconstruir sus medios de subsistencia y la infraestructura básica, sobre todo en los sectores de salud y de abastecimiento de agua.
 
En otros países, el CICR continúa adaptando su estructura y sus operaciones; las disminuye en las situaciones de posconflicto, como Angola, República Democrática del Congo y Sierra Leona.